Les îles
Les îles à l’est de Madagascar (c’est-à-dire à l’exception de celles du canal du Mozambique et des Comores) se trouvent toutes sur le passage du courant sud-équatorial. Ce courant dirigé par le vent est est peu profond et est considéré comme ne changeant que peu de force et de direction, chaque saison ou chaque année. Cependant, cette conclusion peut-être la conséquence d’observations insuffisantes dans la région. L’effet des masses d’eau qui circulent sur les régions de plateaux étroites de la plupart des îles n’est pas bien connu, mais on peut estimer que cela participe à la bathymétrie au large et à la présence ou non de récifs coralliens. Le flux du courant sud équatorial sur la dorsale des Mascareignes entre l’île Maurice et les Seychelles n’a été établi que récemment. Cette obstruction peu profonde du flux en direction de l'ouest concentre le courant en un certain nombre de jets étroits dans les parties les plus profondes de la dorsale. Une efflorescence saisonnière de phytoplanctons commence le long de la côte est de Madagascar avec le début de l’hiver et progresse comme une vague de productivité vers l’Est alors que la thermocline saisonnière s’approfondit et que les nutriments des bas fonds deviennent disponibles dans la zone euphotique.
Il existe une autre perturbation importante à la nature inamovible et invariable de ce composant de l’ASCLME. Il a été démontré que les méandres méridionaux dans le courant sud-équatorial circulaient vers l’Est comme des ondes de Rossby. Des tourbillons y sont inclus. Ces tourbillons s’intensifient alors qu’ils se déplacent vers l’Ouest et sont susceptibles d’avoir une influence décisive sur la circulation de l’océan au niveau des îles qu’ils traversent. Il a été démontré qu’ils pouvaient , ainsi que des tourbillons provenant du canal du Mozambique, atteindre au final le courant Agulhas et déclencher des impulsions du Natal avec tous les effets liés aux changements de courant.